在基礎(chǔ)生物學(xué)研究中,誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)的培養(yǎng)核心是維持其未分化狀態(tài)、多能性和遺傳穩(wěn)定性,同時(shí)滿(mǎn)足實(shí)驗(yàn)的特異性需求(如單細(xì)胞克隆、基因編輯、分化潛能驗(yàn)證等)??茖W(xué)家選擇適合的iPSC培養(yǎng)基,需遵循“先明確實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)→再匹配培養(yǎng)基類(lèi)型→最后驗(yàn)證關(guān)鍵性能”的邏輯,結(jié)合自身研究場(chǎng)景逐步篩選,具體可分為以下六個(gè)核心步驟:
一、明確核心實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo),劃定培養(yǎng)基選擇范圍
不同的基礎(chǔ)研究方向?qū)PSC的狀態(tài)要求差異顯著,這是選擇培養(yǎng)基的首要依據(jù)。
若聚焦iPSC的長(zhǎng)期維持與遺傳穩(wěn)定性
適用于細(xì)胞系建立、傳代保種、基因型鑒定等研究,需優(yōu)先選擇成分明確、無(wú)血清/無(wú)飼養(yǎng)層的培養(yǎng)基。這類(lèi)培養(yǎng)基可避免血清中不明成分(如生長(zhǎng)因子、蛋白酶抑制劑)和飼養(yǎng)層細(xì)胞(如小鼠胚胎成纖維細(xì)胞MEF)帶來(lái)的批次差異、異種蛋白污染,減少iPSC在長(zhǎng)期傳代中發(fā)生遺傳漂變的風(fēng)險(xiǎn),確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可重復(fù)性。
若需開(kāi)展單細(xì)胞克隆或單細(xì)胞分選實(shí)驗(yàn)
這類(lèi)實(shí)驗(yàn)對(duì)細(xì)胞的存活率和貼壁能力要求很高,普通培養(yǎng)基難以支撐單細(xì)胞的增殖。需選擇添加單細(xì)胞克隆促進(jìn)因子(如Rho相關(guān)激酶抑制劑ROCKi)的專(zhuān)用培養(yǎng)基,ROCKi可抑制單細(xì)胞凋亡,提高克隆形成率,滿(mǎn)足單細(xì)胞測(cè)序、基因編輯陽(yáng)性克隆篩選等實(shí)驗(yàn)需求。
若研究方向是iPSC的定向分化潛能
需選擇兼顧未分化維持與分化靈活性的培養(yǎng)基。部分培養(yǎng)基為強(qiáng)化多能性會(huì)添加高濃度的多能性因子(如bFGF、TGF-β),但可能會(huì)抑制后續(xù)的分化啟動(dòng);而基礎(chǔ)型無(wú)血清培養(yǎng)基的成分更簡(jiǎn)潔,對(duì)分化信號(hào)的響應(yīng)更靈敏,更適合用于驗(yàn)證iPSC向三胚層細(xì)胞的分化能力。
若涉及高通量篩選或自動(dòng)化培養(yǎng)
需選擇適配懸浮培養(yǎng)或3D培養(yǎng)體系的培養(yǎng)基,同時(shí)要求培養(yǎng)基具有良好的均一性和批次穩(wěn)定性,能夠兼容自動(dòng)化設(shè)備(如細(xì)胞分選儀、高通量成像系統(tǒng))的操作流程,避免因培養(yǎng)基黏度、細(xì)胞團(tuán)聚等問(wèn)題影響實(shí)驗(yàn)效率。
二、區(qū)分培養(yǎng)基類(lèi)型,匹配實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)條件
iPSC培養(yǎng)基主要分為飼養(yǎng)層依賴(lài)型培養(yǎng)基和無(wú)飼養(yǎng)層無(wú)血清培養(yǎng)基兩大類(lèi),二者的適用場(chǎng)景和技術(shù)門(mén)檻差異較大,需結(jié)合實(shí)驗(yàn)室的培養(yǎng)條件選擇。
飼養(yǎng)層依賴(lài)型培養(yǎng)基(含血清)
核心特點(diǎn):以MEF或人源飼養(yǎng)層細(xì)胞為支持,搭配含血清的基礎(chǔ)培養(yǎng)基(如DMEM/F12+胎牛血清FBS),并添加bFGF等生長(zhǎng)因子。成本較低,細(xì)胞貼壁效果好,適合新手建立iPSC培養(yǎng)體系。
局限性:存在異種蛋白污染風(fēng)險(xiǎn),血清批次差異大,iPSC的遺傳穩(wěn)定性易受影響,不適合用于后續(xù)的臨床研究或基因編輯實(shí)驗(yàn)。
適用場(chǎng)景:基礎(chǔ)生物學(xué)中的初步探索性實(shí)驗(yàn),或?qū)嶒?yàn)室經(jīng)費(fèi)有限、缺乏無(wú)血清培養(yǎng)經(jīng)驗(yàn)的情況。
無(wú)飼養(yǎng)層無(wú)血清培養(yǎng)基(成分明確型)
核心特點(diǎn):無(wú)需飼養(yǎng)層細(xì)胞,培養(yǎng)基成分完全明確(包括重組蛋白生長(zhǎng)因子、氨基酸、維生素等),不含血清和動(dòng)物源成分。可大程度降低外源污染,維持iPSC的多能性和遺傳穩(wěn)定性,是目前基礎(chǔ)研究的主流選擇。
分類(lèi)與選擇:
基礎(chǔ)型無(wú)血清培養(yǎng)基:僅含維持未分化狀態(tài)的核心因子(如bFGF、ActivinA),成分簡(jiǎn)潔,適合常規(guī)傳代和分化實(shí)驗(yàn)。
增強(qiáng)型無(wú)血清培養(yǎng)基:添加ROCKi、抗氧化劑(如谷胱甘肽)等成分,可提高細(xì)胞存活率和克隆形成率,適合單細(xì)胞培養(yǎng)、凍存復(fù)蘇后的細(xì)胞恢復(fù)。
適用場(chǎng)景:需要嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)變量的研究(如表觀遺傳調(diào)控、信號(hào)通路機(jī)制研究)、基因編輯后的細(xì)胞培養(yǎng)、分化潛能驗(yàn)證等。
化學(xué)成分限定培養(yǎng)基(CDM)
核心特點(diǎn):所有成分(包括蛋白、激素、無(wú)機(jī)鹽)的種類(lèi)和濃度均完全明確,無(wú)任何未知成分,是目前標(biāo)準(zhǔn)化程度最高的iPSC培養(yǎng)基。
適用場(chǎng)景:對(duì)實(shí)驗(yàn)重復(fù)性要求很高的研究(如iPSC的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、蛋白質(zhì)組學(xué)分析),或需要排除外源成分干擾的機(jī)制研究。